No.
La prima cosa da fare è togliere il calcolo usando le coordinate (le coordinate le puoi lasciare). In proprietà->pos. geografico togli la prima spunta e rifai il calcolo.
Se è tutto ok dovrebbe tornare esattamente come prima.
Poi...perchè il programma tenga allineato il disegno alla poligonale è indispesabile che questo sia 'agganciato' ad essa. Perché questo avvenga la poligonale deve essere associata ad almeno una grotta (o ramo/sottoramo ecc) e ogni oggetti disegnato sia a sua volta associato alla stessa gerarchia (grotta, appunto, ed eventuale ramo/sottoramo ecc). Una volta associato tutto (puoi associare gli oggetti rapidamente anche dopo averli disegnati selezionandoli tutti mentre la battute di poligonale possono essere associate usando la funzione replica dati) controlla, utilizzando la funzione Disegno->Poligonale->Mostra collegamenti che dalla grafica partano opportune linee di collegament che, ti mostreranno, le connessioni, appunto, tra disegno e poligonale. Se tutto torna e tutto risulta collegato verifica che in proprieta->opzioni di calcolo->warping ci sia Semplice. Impostata quest'ultima cosa riattiva le funzioni geografiche e il disegno ruoterà con la poligonale e continuerà a cambiare di conseguenza.
Esistono poi vari modi per lavorare direttamente per grotta e ramo che sono pensati per agevolare (leggi: automatizzare, per quanto possibile) l'associazione tra disegno e poligonale. E' spiegato tutto abbastanza bene nel manuale da pagina 48...